[1] | Y. J. Liang, J. L. Wei, X. Qiu, N. Jiao, Chem. Rev., 2018, 118, 4912-4945. | [2] | S. N. Charlton, M. A. Hayes, ChemMedChem, 2022, 17, e202200115. | [3] | S. C. Dodani, G. Kiss, J. K. B. Cahn, Y. Su, V. S. Pande, F. H. Arnold, Nat. Chem., 2016, 8, 419-425. | [4] | G. Y. Li, M. Garcia-Borras, M. J. L. J. Furst, A. Ilie, M. W. Fraaije, K. N. Houk, M. T. Reetz, J. Am. Chem. Soc., 2018, 140, 10464-10472. | [5] | C. G. Acevedo-Rocha, C. G. Gamble, R. Lonsdale, A. T. Li, N. Nett, S. Hoebenreich, J. B. Lingnau, C. Wirtz, C. Fares, H. Hinrichs, A. Deege, A. J. Mulholland, Y. Nov, D. Leys, K. J. McLean, A. W. Munro, M. T. Reetz, ACS Catal., 2018, 8, 3395-3410. | [6] | C. Gally, B. M. Nestl, B. Hauer, Angew. Chem. Int. Ed., 2015, 54, 12952-12956. | [7] | R. J. Li, A. T. Li, J. Zhao, Q. Chen, N. Li, H. L. Yu, J. H. Xu, Catal. Sci. Technol., 2018, 8, 4638-4644 | [8] | B. P. Branchaud, C. T. Walsh, J. Am. Chem. Soc., 1985, 107, 2153-2161. | [9] | M. Renz, M. Bernard, Eur. J Org. Chem., 1999, 737-750. | [10] | M. D. Mihovilovic, B. Müller, P. Stanetty, Eur. J. Org. Chem., 2002, 3711-3730. | [11] | H. Leisch, K. Morley, P. C. K. Lau, Chem. Rev., 2011, 111, 4165-4222. | [12] | J. L. Han, V. A. Soloshonok, K. D. Klika, J. Drabowicz, A. Wzorek, Chem. Soc. Rev., 2018, 47, 1307-1350. | [13] | E. Romero, J. R. G. Castellanos, G. Gadda, M. W. Fraaije, A. Mattevi, Chem. Rev., 2018, 118, 1742-1769. | [14] | M. J. L. J. Furst, A. Gran-Scheuch, F. S. Aalbers, M. W. Fraaije, ACS Catal., 2019, 9, 11207-11241. | [15] | S. Schmidt, U. T. Bornscheuer, Chapter Nine, Enzymes, 2020, 47, 231-281 | [16] | C. E. Paul, D. Eggerichs, A. H. Westphal, D. Tischler, W. J. H. van Berkel, Biotechnol. Adv., 2021, 51,107712 | [17] | T. Matsui, Y. Dekishima, M. Ueda, Appl. Microbiol. Biotechnol., 2014, 98, 7699-7706. | [18] | I. Fernandez, N. Khiar, Chem. Rev., 2003, 103, 3651-3706. | [19] | Y. Zhang, Y. Q. Wu, N. Xu, Q. Zhao, H. L. Yu, J. H. Xu, ACS Sustainable Chem. Eng., 2019, 7, 7218-7226. | [20] | K. Balke, A. Beier, U. T. Bornscheuer, Biotechnol. Adv., 2018, 36, 247-263. | [21] | M. L. Mascotti, M. J. Ayub, H. Dudek, M. K. Sanz, M. W. Fraaije, AMB Express, 2013, 3, 33. | [22] | F. Liu, C. Shou, Q. Geng, C. Zhao, J. H. Xu, H. L. Yu, Appl. Microbiol. Biotechnol., 2021, 105, 3169-3180. | [23] | S. Bordewick, A. Beier, K. Balke, U. T. Bornscheuer, Enzyme Microbial. Technol., 2018, 109, 31-42. | [24] | M. T. Reetz, F. Daligault, B. Brunner, H. Hinrichs, A. Deege, Angew. Chem. Int. Ed., 2004, 43, 4078-4081. | [25] | F. M. Ferroni, M. S. Smit, D. J. Opperman, J. Mol. Catal. B, 2014, 107, 47-54. | [26] | Z. G. Zhang, R. Lonsdale, J. Sanchis, M. T. Reetz, J. Am. Chem. Soc., 2014, 136, 17262-17272. | [27] | C. C. Ryerson, D. P. Ballou, C. Walsh, Biochemistry, 1982, 21, 2644-2655 | [28] | J. A. Latham, C. Walsh, J. Am. Chem. Soc., 1987, 109, 3421-3427. | [29] | C. Walsh, J. Latham, J. Protein Chem., 1986, 5, 79-87. | [30] | D. W. Sheng, D. P. Ballou, V. Massey, Biochemistry, 2001, 40, 11156-11167. | [31] | I. A. Mirza, B. J. Yachnin, S. Wang, S. Grosse, H. Bergeron, A. Imura, H. Iwaki, Y. Hasegawa, P. C. K. Lau, A. M. Berghuis, J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 8848-8854. | [32] | B. J. Yachnin, T. Sprules, M. B. McEvoy, P. C. K. Lau, A. M. Berghuis, J. Am. Chem. Soc., 2012, 134, 7788-7795. | [33] | I. Polyak, M. T. Reetz, W. Thiel, J. Am. Chem. Soc., 2012, 134, 2732-2741. | [34] | D. E. Torres Pazmino, B. J. Baas, D. B. Janssen, M. W. Fraaije, Biochemistry, 2008, 47, 4082-4093. | [35] | J. Sucharitakul, T. Wongnate, P. Chaiyen, J. Biol. Chem., 2011, 286, 16900-16909. | [36] | T. C. Bruice, J. B. Noar, S. S. Ball, U. V. Venkataram, J. Am. Chem. Soc., 1983, 105, 2452-2463. | [37] | A. C. C. Barbosa, R. P. P. Neves, S. F. Sousa, M. J. Ramos, P. A. Fernandes, ACS Catal., 2018, 8, 9298-9311. | [38] | N. Xu, J. Zhu, Y. Q. Wu, Y. Zhang, J. Y. Xia, Q. Zhao, G. Q. Lin, H. L. Yu, J. H. Xu, Org. Process Res. Dev., 2020, 24, 1124-1130. | [39] | Y. K. Bong, M. D. Clay, S. J. Collier, B. Mijts, M. Vogel, X. Zhang, J. Zhu, J. Nazor, D. Smith, S. Song, WO Patent, WO2011071982A2, 2011. | [40] | Y. K. Bong, S. Song, J. Nazor, M. Vogel, M. Widegren, D. Smith, S. J. Collier, R. Wilson, S. M. Palanivel, K. Narayanaswamy, B. Mijts, M. D. Clay, R. Fong, J. Colbeck, A. Appaswami, S. Muley, J. Zhu, X. Zhang, J. Liang, D. Entwistle, J. Org. Chem., 2018, 83, 7453-7458. | [41] | O. Trott, A. J. Olson, J. Comput. Chem., 2010, 31, 455-461. | [42] | H. Li, A. D. Robertson, J. H. Jensen, Proteins: Struct., Funct., Bioinform., 2005, 61, 704-721. | [43] | D. A. Case, I. Y. Ben-Shalom, S. R. Brozell, D. S. Cerutti, T. E. Cheatham, III, V. W. D. Cruzeiro, T. A. Darden, R. E. Duke, D. Ghoreishi, M. K. Gilson, H. Gohlke, A. W. Goetz, D. Greene, R. Harris, N. Homeyer, Y. Huang, S. Izadi, A. Kovalenko, T. Kurtzman, T. S. Lee, S. LeGrand, P. Li, C. Lin, J. Liu, T. Luchko, R. Luo, D. J. Mermelstein, K. M. Merz, Y. Miao, G. Monard, C. Nguyen, H. Nguyen, I. Omelyan, A. Onufriev, F. Pan, R. Qi, D. R. Roe, A. Roitberg, C. Sagui, S. Schott-Verdugo, J. Shen, C. L. Simmerling, J. Smith, R. SalomonFerrer, J. Swails, R. C. Walker, J. Wang, H. Wei, R. M. Wolf, X. Wu, L. Xiao, D. M. York, P. A. Kollman, AMBER 2018, University of California, San Francisco, 2018. | [44] | J. M. Wang, R. M. Wolf, J. W. Caldwell, P. A. Kollman, D. A. Case, J. Comput. Chem., 2004, 25, 1157-1174. | [45] | C. I. Bayly, P. Cieplak, W. D. Cornell, P. A. Kollman, J. Phys. Chem., 1993, 97, 10269-10280. | [46] | W. L. Jorgensen, J. Chandrasekhar, J. D. Madura, R. W. Impey, M. L. Klein, J. Chem. Phys., 1983, 79, 926-935. | [47] | J. A. Maier, C. Martinez, K. Kasavajhala, L. Wickstrom, K. E. Hauser, C. Simmerling, J. Chem. Theory Comput., 2015, 11, 3696-3713. | [48] | C. L. Brooks III, J. Solution Chem., 1989, 18, 99. | [49] | W. F. van Gunsteren, H. J. C. Berendsen, Angew. Chem. Int. Ed., 1990, 29, 992-1023. | [50] | V. Kräutler, W. F. van Gunsteren, P. H. Hünenberger. J. Comput. Chem., 2001, 22, 501-508. | [51] | P. Sherwood, A. H. de Vries, M. F. Guest, G. Schreckenbach, C. R. A. Catlow, S. A. French, A. A. Sokol, S. T. Bromley, W. Thiel, A. J. Turner, S. Billeter, F. Terstegen, S. Thiel, J. Kendrick, S. C. Rogers, J. Casci, M. Watson, F. King, E. Karlsen, M. Sjøvoll, A. Fahmi, A. Schäfer, C. Lennartz, J. Mol. Struct.: Theochem., 2003, 632, 1-28. | [52] | R. Ahlrichs, M. Bar, M. Haser, H. Horn, C. Kolmel, Chem. Phys. Lett., 1989, 162, 165-169. | [53] | W. Smith, T. R. Forester, J. Mol. Graphics, 1996, 14, 136-141. | [54] | A. H. de Vries, P. Sherwood, S. J. Collins, A. M. Rigby, M. Rigutto, G. J. Kramer, J. Phys. Chem. B, 1999, 103, 6133-6141. | [55] | P. Sherwood, A. H. de Vries, S. J. Collins, S. P. Greatbanks, N. A. Burton, M. A. Vincent, I. H. Hillier, Faraday Discuss., 1997, 106, 79-92. | [56] | S. Grimme, J. Comput. Chem., 2004, 25, 1463-1473. | [57] | P. Wu, Y. Gu, L. Liao, Y. Wu, J. Jin, Z. Wang, J. Zhou, S. Shaik, B. Wang, Angew. Chem. Int. Ed., 2022, 61, e202214235. | [58] | W. Peng, S. Yan, X. Zhang, L. Liao, J. Zhang, S. Shaik, B. Wang, J. Am. Chem. Soc., 2022, 144, 20484-20494. | [59] | X. Zhang, Y. Jiang, Q. Chen, S. Dong, Y. Feng, Z. Cong, S. Shaik, B. Wang, ACS Catal., 2021, 11, 8774-8785. | [60] | J. Kaestner, J. M. Carr, T. W. Keal, W. Thiel, A. Wander, P. Sherwood, J. Phys. Chem. A, 2009, 113, 11856-11865. | [61] | C. S. Chen, Y. Fujimoto, G. Girdaukas, C. J. Sih, J. Am. Chem. Soc., 1982, 104, 7294-7299. | [62] | S. Zhu, Y. Wu, Z. Yu, Proc. Biochem., 2006, 41, 1688-1691. | [63] | W. R. Berendsen, G. Gendrot, S. Resnick, M. Reuss, J. Biotechnol., 2006, 121, 213-226. | [64] | E. Romero, J. R. G. Castellanos, A. Mattevi, M. W. Fraaije, Angew. Chem. Int. Ed., 2016, 55, 15852-15855. | [65] | D. Lim, K. Poole, N. C. J. Strynadka, J. Biol. Chem., 2002, 277, 29253-29259. | [66] | H. L. Messiha, S. T. Ahmed, V. Karuppiah, R. Suardiaz, G. A. Ascue Avalos, N. Fey, S. Yeates, H. S. Toogood, A. J. Mulholland, N. S. Scrutton, Biochemistry, 2018, 57, 1997-2008. | [67] | M. J. L. J. Fürst, S. Savino, H. M. Dudek, J. R. Gomez Castellanos, C. Gutierrez de Souza, S. Rovida, M. W. Fraaije, A. Mattevi, J. Am. Chem. Soc., 2016, 139, 627-630. | [68] | M. T. Reetz, B. Brunner, T. Schneider, F. Schulz, C. M. Clouthier, M. M. Kayser, Angew. Chem. Int. Ed., 2004, 43, 4075-4078. | [69] | K. Balke, S. Schmidt, M. Genz, U. T. Bornscheuer, ACS Chem. Biol., 2016, 11, 38-43. | [70] | M. D. Mihovilovic, F. Rudroff, A. Winninger, T. Schneider, F. Schulz, M. T. Reetz, Org. Lett., 2006, 8, 1221-1224. | [71] | S. Takahashi, Y. Zhao, P. E. O'Maille, B. T. Greenhagen, J. P. Noel, R. M. Coates, J. Chappell, J. Biol. Chem., 2005, 280, 3686-3696. | [72] | T. Yamazaki, T. Ohno, T. Sakaki, M. Akiyoshi-Shibata, Y. Yabusaki, T. Imai, S. Kominami, Biochemistry, 1998, 37, 2800-2806. | [73] | J. Carro, P. Ferreira, L. Rodriguez, A. Prieto, A. Serrano, B. Balcells, A. Arda, J. Jimenez-Barbero, A. Gutierrez, R. Ullrich, M. Hofrichter, A. T. Martine, FEBS J., 2015, 282, 3218-3229. |
|